现在注册公司不再是三证合一而是多证合一，普通的公司默认是以下的几个：

(工商、市场监管部门)营业执照
 
(公安厅)公章刻制备案
 
(人社部门)社会保险登记证
 
(税务部门)税务登记证
 
(统计局)统计证
 
(质监局)机构代码证
 
(住建部门)单位办理住房公积金缴存登记

(人民银行)开户许可证

其它特殊行业根据自身所在行业，具体是以下这些：

(商务厅)对外贸易经营者备案登记
 
(商务厅)再生资源回收经营者备案
 
(商务厅)国际货运代理企业备案
 
(公安厅)娱乐服务场所备案
 
(公安厅)金银首饰加工业备案
 
(公安厅)机动车租赁业备案
 
(公安厅)报废机动车回收拆解业备案
 
(公安厅)寄卖业备案
 
(公安厅)开锁业备案
 
(公安厅)机动车维修业备案
 
(公安厅)废旧金属收购业备案
 
(公安厅)旅馆歇业、转业、合并、迁移、改变名称等情况备案
 
(公安厅)互联网上网服务营业场所经营单位变更名称、住所、法定代表人或者主要负责人、注册资本、网络地址或者终止经营活动备案
 
(海关部门)原产地证企业备案登记
 
(交通部门)道路货物运输经营者变更名称、地址备案
 
(交通部门)道路客运经营者、货运经营者设立分公司备案

(交通部门)货运代理（代办）备案
 
(交通部门)船员服务机构设立备案
 
(交通部门)船舶交易服务机构备案
 
(旅游管理部门)旅行社分社备案
 
(旅游管理部门)旅行社变更、注销备案（除经营出境旅游业务旅行社）
 
(农业部门)生猪屠宰所有权或经营权变更备案
 
(财政厅)资产评估机构及其分支机构备案
 
(粮食管理部门)粮油仓储企业备案
 
(发展改革委)创业投资企业备案
 
(文化部门)企业或者其他经营单位增设艺术品经营业务备案
 
(文化部门)艺术品经营单位设立或进出口经营活动单位备案
 
(文化部门)演出场所经营单位备案
 
(文化部门)文化经纪单位以及艺术摄影、摄像单位备案
 
(保监部门)保险公估机构及其分支机构设立备案
 
(证监部门)期货公司变更境内分支机构营业场所备案
 
(证监部门)期货公司变更法定代表人、住所或者营业场所备案
 
(证监部门)期货公司设立境内分支机构备案
 
(证监部门)期货公司变更境内分支机构经营范围以及期货公司终止境内分支机构备案
 
(住建部门)房地产经纪机构及其分支机构备案
 
(住建部门)物业服务企业及其分支机构备案
 
(海关部门)海关进出口货物收发货人备案（含报关报检资质）
 
(出版行政主管部门)设立出版物出租企业或者其他单位、个人从事出版物出租业务备案
 
(气象管理部门)气象信息服务企业备案